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IGV - Splice Junction 설정 본문

Bioinformatics/IGV

IGV - Splice Junction 설정

Kisung Moon 2021. 4. 30. 19:22

일반적인 방법으로 Sashimi plot을 출력했을 때 작은 junction 값도 출력되어서 유의미한 값을 시각적으로 파악하기 어려워진다.

 

Minimum junction coverage 설정 전

 

 

다음과 같은 방법으로 Minimum junction coverage를 설정해준다.

View-Preferences
View-Preferences-Alignments-Splice Junction Track

Minimum junction coverage 값을 5로 설정하여 5미만의 값들을 제거해주었고 더욱 깔끔하게 시각화가 가능한 것을 볼 수 있다.

Minimum junction coverage 설정 후

 

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