Bioinformatics/IGV
IGV - Splice Junction 설정
Kisung Moon
2021. 4. 30. 19:22
일반적인 방법으로 Sashimi plot을 출력했을 때 작은 junction 값도 출력되어서 유의미한 값을 시각적으로 파악하기 어려워진다.
다음과 같은 방법으로 Minimum junction coverage를 설정해준다.
Minimum junction coverage 값을 5로 설정하여 5미만의 값들을 제거해주었고 더욱 깔끔하게 시각화가 가능한 것을 볼 수 있다.
